עין גדי הוא נווה המדבר המשמעותי ביותר בחוף המערבי של ים המלח. במקום זה, נתגלו לאורך השנים שרידיה של פעילות אנושית ענפה, החל בבנייתו של מקדש מבודד בתקופה הכלקוליתית, המשך בפיתוחו של האתר לכדי מרכז תעשייתי מרכזי בתקופת הברזל, ועד להפיכתו לכפר יהודי גדול בתקופות הרומית והביזנטית.

בשנים האחרונות מתקיימות בתחומי נווה עין גדי חפירות ארכיאולוגיות מחודשות אשר שמו להן למטרה לבחון מחדש היבטים שטרם נחקרו בתולדותיו של נווה המדבר. חפירות אלה, המתקיימות מטעם מספר חוקרים, נערכו במגוון אתרים בתוך עין גדי:

מדרגת מעיין עין גדי. במהלך שנת 2019 התקיימו חפירות ארכיאולוגיות באזור מדרגת מעיין עין גדי בניהולם של ד"ר אורי דוידוביץ' וד"ר נמרוד מרום. חפירות אלו נערכו בקרבת שני מבנים מתקופות שונות: (א) מבנה 'המגדל הישראלי' מתקופת הברזל המאוחרת, הנמצא ליד מעיין עין גדי אשר נחפר בעבר בידי בנימין מזר; (ב) מבנה מן התקופה הרומית הנתון בקצה הצפוני של מדרגת המעיין, סמוך לנחל דוד, אשר נחשף לראשונה בחפירה זו.

תל גורן. במהלך שנת 2020, נערכו חפירות מחודשות בתל גורן שבמישור נווה עין גדי, ליד שפך נחל ערוגות. בחפירות בתל גורן נועדו לחשוף שרידים נוספים מן היישוב בעין גדי בתקופת הברזל ובתקופה הפרסית, ולברר מחדש מספר שאלות ובעיות הקשורות לתולדותיו של התל ואופן התפתחותו.

מערת המורינגה. בשנת 2020, נערכו חפירה מחודשת בתחומי מערת המורינגה ובמדרון שסביבתה. בחפירות אלה נחשפו שרידים מן התקופה ההלניסטית בתוך מערה הסמוכה מצפון למערת המורינגה.

"גבעת המצבות". בשנת 2022 נערכו חפירות ארכיאולגיות בשלוחה הנתונה מדרום לנחל דוד, הידועה בפי אנשי קיבוץ עין גדי בשם "גבעת המצבות". חפירה זו, בהובלתם של ד"ר אורי דוידוביץ', ד"ר גדעון הדס, רועי פורת וד"ר אורית פלג-ברקת, חשפה על פני השלוחה את שרידיו של אתר יישוב מן התקופה ההלניסטית והרומית אשר לא היה ידוע בתולדות הנווה.